Вопросы охраны окружающей среды и экологического мониторинга входят в число самых острые и актуальных в современном мире. Беспилотные летательные и водные аппараты дополняют, а в ряде случаях — заменяют традиционные средства экомониторинга. Они определяют уровень загрязнения окружающей среды, обнаруживают опасные вещества, контролируют и прогнозируют экологические обстановки. Мультикоптеры производят забор воды, регистрируют разливы нефтепродуктов и опасных химикатов. Они имеют подвесное дозимитрическое оборудование для измерения ионизирующего излучения. Оснащены программным обеспечение для картирования загрязнений.
Дроны позволяют исследовать экологическую обстановку в труднодоступных местах и оперативно получать информацию о состоянии окружающей среды без риска для сотрудников. БПЛА могут выполнять задачи на предельно малых высотах и на скорости вплоть до нулевой. Время развёртывания дрона опытным специалистом не превышает нескольких минут, что позволит не терять драгоценное время при техногенных авариях.